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但是，从全国范围来说，各地区医保信息化建设程度差异很大，实现全国范围的异地结算，工程难度可想而知。
同时从信息化技术来说，目前，医保核心平台实现的是一种低层次的整合，整合的效果不好。对于未来强化医保对医疗机构的监督职能，医保要通过合理的支付方式控制和引导医疗费用的支出，这就需要医保信息系统内的数据挖掘功能得到增强，医疗保险的信息化建设需要一个高层次整合的数据平台。
“当前迫切要解决的问题是药品目录和诊疗目录的统一、规范，这将为异地就医工作提供可通讯的协议。当然，只统一标准而不统一软件，将难以推进业务规范化管理，难以保证业务流程的统一，软件核心平台的建设也迫在眉睫。”劳动保障部社保中心副主任吴光表示。
医疗保险实际的系统交易量和数据量巨大，需要容纳全部投保社会人口的个人账户及逐笔交易数据。所以对系统的可扩展性、可靠性、安全性要求都比较高。毫无疑问，这项耗资、耗物、耗人、耗时的庞大工程，将是对包括李小龙在内的IT系统的设计者带来考验。
福建经验
异地结算方面，福建作为第一个省级行政区，在国内第一次实现了本省以内异地就医系统的架设工作。
系统自2006年2月正式上线以来，省本级和9个市本级已可相互开展异地就医实施结算费用工作，可实施异地就医的定点医疗机构49家，定点药店24家，异地就医已登记12500余人，异地药店购药6100人次，异地就医费用结算达3870万元。
上述成果得来并非易事，信息化工作渗透在福建医疗系统日常工作的点滴中。
在福建部分地区，居民除了通常的居民身份证外，还都拥有一张“居民健康身份证”。这张“居民健康身份证”就是居民健康档案信息化管理的核心工具，里面详细登记了居民身体情况，包括药物过敏史、用药情况等等。
1998年，福州、厦门首先开始为居民建立健康档案，如今从医保信息的异地共享来看，当初的档案设定显得尤为重要。
2007年，福建省有63个县(市、区)开展了社区卫生服务，占全省县(市、区)的75%；社区卫生服务中心139个，社区卫生服务站322个，覆盖人口609万人，累计建立居民健康档案152.4万份。
今年，作为福建省医疗系统信息化建设的一项任务，该省将加快全省新型农村合作医疗信息平台建设。在公费医疗、城镇职工医疗、城镇居民医疗、社区医疗等各个层级的医疗保障信息化建设后，新农合医疗保险的平台建设，将通过信息化的手段将医疗保险惠及更多的人。
福建省明确表示，将"继续推动各设区市加快建设新型农村合作医疗管理平台和应用系统，推进社保卡在新农合系统中的应用"。
同时，全省社会保障卡系统建设。加快启动社保卡系统建设，开展社保卡在城镇医疗等社会保险系统和就业、新农合系统中的应用，实现医疗就诊一卡通。结合社保卡项目，建设全省居民健康信息系统，实现居民健康信息和电子病历共享。
据了解，福建省下辖9个地级以上城市，在全省异地医保系统建设之前，各地市在医保政策、业务规范等方面存在不小的差异。为保证异地业务的顺利和正常开展，福建省把统一相关政策和业务流程摆在了关键位置，开创性地做了大量的工作。
制定了异地就医过程中关于就医标准和经费结算等业务的处理方法和业务流程。同时启用新的药品及诊疗项目编码，推行了新网络、新编码、新结构、新信息分析决策支持系统等“四新”举措。
不过，福建省内医疗保险资源的共享，与长三角地区，两省一市的账户联网难度不一样，信息化建设的复杂程度也不一样，庆幸的是，包括镇江市在内的长三角地方政府已经开始积极投入其中。
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